江西农大公布迄今最全面完整的猪肠道微生物基因集

2月17日,中国科学院院士黄路生领衔的江西农业大学科研团队在国际顶级学术期刊《Nature Communications》发表重要科研成果,提供了目前为止国际上最为全面完整的猪肠道微生物基因集和宏基因组组装的微生物基因组。该成果为猪肠道菌群相关研究以及分析肠道菌群对猪生长速度、饲料利用率等经济性状的影响等提供了重要的基础数据和资源。

据了解,猪的胃肠道中有数百万亿细菌,它们在猪的新陈代谢、免疫甚至行为中起着至关重要的作用,参考基因及高质量的微生物基因组是研究肠道菌群与猪的重要经济性状的因果关系必不可少的资源,但目前已有的数据库中,40%-50%的肠道微生物缺乏参考基因组和注释信息。研究中,黄路生院士及江西农大首席教授陈从英带领团队通过对来自不同年龄、性别、品种、地理区域、不同肠道部位和来源野猪的500个样本,进行深度宏基因组测序,并整合现有的猪肠道菌群基因组,构建了整合的猪肠道微生物基因目录(PIGC)和基于宏基因组组装的微生物基因组(MAG)。

据悉,作为构建的猪肠道微生物基因集和MAG使用的范例,该研究还比较了野猪和高度商业化杜洛克两种代表截然不同饲养条件下的猪肠道微生物组。

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